Amira是澳大利亚Visage Imaging公司出品的一个功能强大的，多方面的工具软件，用于对数据进行可视化，操纵控制，2012年7月31日VSG公司宣布收购Amira，VSG旗下还拥有open inventor和Avizo.

Amira能够识别生命科学和生物医学的数据的来源以及类型、方式，这些类型包括：光学和电子显微镜、CT，MR，PET，SPECT，超声波、工程和表面建模工具、蛋白数据库和分子模拟，以及各种物理测量和模拟。

当多维数据需要加以可视化并进行探索的时候，Amira提供了一个极其丰富的一套功能强大的工具与一个直观和易于使用的图形用户界面。

Amira软件中所提供的先进的可视化技术，让你对数据获得详细的了解。自动和交互式分割和建模工具，支持灵活创造的三维表面和有限元模型为最优的可视化和模拟。现代图形硬件被有效的利用来显示大型数据集，在互动速度与图像质量方面都无与伦比。Amira的三维渲染功能强大,无论是用于三维数据研究还是演示都能获得优秀的效果。

Amira的主要功能：

处理和重构：通过各种数字过滤器及交互式编辑器来处理图像；对图像体内的组织和区域进行重构。

·图像过滤

·曲面的生成

·图像选取

·切片对齐校正

·自动和手动配准

·体积和图像取样

·体积裁切

·对体积数据直接编辑

·曲面资料编辑

·数据类型转换

·脚本编辑

·三维多平面重建视图融合

·三维多平面重建视图中自动及手动配准

可视化和探索：拥有快速交互式及高质量的可视化技术，您可以轻易的通过裁剪和配色来探索体数据。

·正切面、斜切面及曲线切片

·多分辨率的体渲染及阴影

·曲面渲染

·等值线和等值面

·多色频的图像可视化

·图像融合

·高度场

· 正切面投影

·线状结构的可视化追踪

·三维特定区域的选取

·裁切与切割

·时间序列数据可视化

·三维多平面重建查看复杂数据集

分析和量化：利用高级的统计工具对体进行面和网格分析；交互的完成对距离、角度、面和体的几何测量；Amira同MATLAB相结合，执行模拟和先进的数字分析功能。

·组织材料分析统计

·体积和曲面的测量

·2D/三维线性测量及标注

·联合定位分析

·数值运算

·密度测定

·曲面分析

·结合MATLAB引擎

·网络统计

展示和教学：创建高质量的基于事件时间轴的交互式立体或非立体演示，并生成动画或视频演示文件。

·动画制作工具

·高质量的演示影片

·影片的生成

·多样化的三维立体演示模型

·支持自动立体演示

·二维和三维动画标注展示

FEI

Amira

6.0.1 (Win/Mac/Lnx)

Win x86: 947 Mb | Win x64: 994 Mb | MacOSX: 952 Mb | Linux x64: 963 Mb

Amira is a powerful, multifaceted 3D software platform for visualizing, manipulating, and understanding data from computed tomography, microscopy, MRI, and many other imaging modalities.

With incredible speed and flexibility, Amira enables advanced 3D imaging workflows for specialists in research areas ranging from molecular and cellular biology to neuroscience and bioengineering.

Import & process

Import any 2D / 3D image data or time series from multiple modalities: Optical and Electron Microscopes, CT-scanners, Nano-tomographs, Synchrotrons…

Align and register image stacks. Apply advanced image filters and operators to dramatically enhance image quality.

Use powerful thresholding and segmentation tools, correlation plot, object separation, filament and network tracing, to perform advanced processing on your 3D data and reveal and identify features and structures.

Visualize and explore

Amira provides fast, interactive and high-quality visualization techniques and easy-to-use tools to explore and perform visual analytics on your 3D data:

- High-quality volume rendering

- Colormaps and transparencies

- Clipping, Probing, Slicing

- Isolines and surfaces

Share and communicate

Create high quality presentations. Build and export movie clips and animations.

Integrate 3D annotations and measurements. Mix volume, geometries and flow and simulation data visualization.

Generate output for multi-screen display, stereoscopic and even immersive environments.

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